本報(bào)訊 近日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所芝麻與特色油料遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在國(guó)際知名學(xué)術(shù)刊物《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上發(fā)布了植物微衛(wèi)星DNA及其標(biāo)記開(kāi)發(fā)數(shù)據(jù)庫(kù)PMDBase,。該數(shù)據(jù)庫(kù)的創(chuàng)建和共享將為全球作物功能基因組學(xué)和分子育種研究提供全面而便利的基礎(chǔ)平臺(tái),。
微衛(wèi)星DNA，也稱為SSR,，是涉及許多重要生物功能的基因組成分,，已被廣泛地應(yīng)用于作物基礎(chǔ)研究，包括遺傳多樣性,、連鎖和關(guān)聯(lián)作圖,、標(biāo)記輔助選擇、品種鑒定和進(jìn)化分析等,。
據(jù)介紹,，該團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一套便捷高效的微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)鑒定及分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)流程，對(duì)截至目前已完成基因組測(cè)序的110個(gè)植物進(jìn)行了鑒定,，共發(fā)掘微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)26,230,099個(gè),，并為每個(gè)位點(diǎn)開(kāi)發(fā)了3對(duì)引物。用戶可獲取目標(biāo)物種有用的微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)和引物信息,，以及每個(gè)位點(diǎn)所屬物種,、位置、起止,、類(lèi)型,、大小以及序列信息。用戶可以利用數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)在線鑒定及分子標(biāo)記在線設(shè)計(jì),。該數(shù)據(jù)庫(kù)還提供了多種檢索方式和下載功能,，所有數(shù)據(jù)和分析結(jié)果都可下載。
該數(shù)據(jù)庫(kù)為全球研究者們提供了在線的,、友好的,、便利的植物微衛(wèi)星DNA鑒定平臺(tái)，是目前國(guó)際上涵蓋最多植物物種和信息最全面的綜合性數(shù)據(jù)庫(kù)，填補(bǔ)了同領(lǐng)域相關(guān)研究空白,。
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